人工智能打破醫(yī)藥研發(fā)“雙十定律”

AI智藥,即以醫(yī)藥大數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),通過(guò)運(yùn)用機(jī)器學(xué)習(xí)、深度學(xué)習(xí)等AI技術(shù)替代大量實(shí)驗(yàn),對(duì)藥物結(jié)構(gòu)、功效等進(jìn)行快速分析,以達(dá)到縮短試驗(yàn)周期、節(jié)省成本、促進(jìn)新藥發(fā)現(xiàn)、提升試驗(yàn)成功率等目的。

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本文來(lái)自IT時(shí)報(bào),作者/IT時(shí)報(bào)記者潘少穎。

編輯/王昕孫妍

高技術(shù)、高投入、高風(fēng)險(xiǎn)、長(zhǎng)周期……在新藥研發(fā)的過(guò)程中,經(jīng)常面臨著諸多痛點(diǎn)。因此,業(yè)界正在著力布局通過(guò)AI翻過(guò)新藥研發(fā)過(guò)程中的這幾座“大山”,AI智藥成為一條新賽道。全球已經(jīng)有700多家AI智藥企業(yè),共有幾十款A(yù)I藥物進(jìn)入臨床試驗(yàn)階段。至2022年底,我國(guó)也已有AI智藥初創(chuàng)企業(yè)近80家。

張江,有科創(chuàng)、芯片、藥片“三駕馬車”,2022年生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)規(guī)模已經(jīng)達(dá)到3300億元,誕生了全國(guó)15%的原創(chuàng)新藥和10%的創(chuàng)新醫(yī)療器械。近年來(lái),張江積極尋找和布局新賽道、新方向,目前在靶向藥物、合成生物學(xué)、AI+新藥研發(fā)、新型偶聯(lián)藥物、新型蛋白降解藥物、細(xì)胞藥等相關(guān)領(lǐng)域引進(jìn)和聚集了一批創(chuàng)新主體,在前沿技術(shù)領(lǐng)域的發(fā)展和培育上發(fā)揮著創(chuàng)新策源和示范引領(lǐng)作用。

在9月25日開(kāi)幕的2023張江生命科學(xué)國(guó)際創(chuàng)新峰會(huì)上,舉行了2023張江AI智藥論壇暨第三屆AI研發(fā)創(chuàng)新論壇,來(lái)自張江的AI智藥企業(yè)分享了AI賦能藥物研發(fā)的最新成果和前沿案例,并探討了AI技術(shù)應(yīng)用的當(dāng)前挑戰(zhàn)和未來(lái)前景。

不可否認(rèn),AI智藥的創(chuàng)業(yè)熱潮正在涌動(dòng)。

加速建立“AI藥研朋友圈”

AI智藥,即以醫(yī)藥大數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),通過(guò)運(yùn)用機(jī)器學(xué)習(xí)、深度學(xué)習(xí)等AI技術(shù)替代大量實(shí)驗(yàn),對(duì)藥物結(jié)構(gòu)、功效等進(jìn)行快速分析,以達(dá)到縮短試驗(yàn)周期、節(jié)省成本、促進(jìn)新藥發(fā)現(xiàn)、提升試驗(yàn)成功率等目的。

“隨著人工智能技術(shù)的快速變革,AI已經(jīng)成為藥物研發(fā)過(guò)程中縮短研究周期、節(jié)省研發(fā)成本、提升實(shí)驗(yàn)成功率的核心生產(chǎn)力。”中國(guó)科學(xué)院院士饒子和在論壇上這樣表示。

在中國(guó)AI智藥的版圖上,張江占據(jù)著龍頭位置。成立于2019年的英矽智能和成立于2015年的晶泰科技是國(guó)內(nèi)AI制藥領(lǐng)域的獨(dú)角獸,這兩家皆在張江有所布局。作為浦東生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)的聚集地,張江集聚了近7萬(wàn)名生物醫(yī)藥從業(yè)人員。同時(shí),張江正在構(gòu)筑一個(gè)巨大的人工智能產(chǎn)業(yè)生態(tài)圈,匯聚更多的AI新勢(shì)力。早在2021年10月,張江AI新藥研發(fā)聯(lián)盟正式揭牌成立,聯(lián)盟是推進(jìn)AI與醫(yī)藥跨界交叉融合、數(shù)據(jù)資源共享、技術(shù)迭代升級(jí)的重要紐帶,并取得了不少成果。現(xiàn)在,該聯(lián)盟成員已擴(kuò)增至35家。

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美迪西開(kāi)發(fā)的智能靶點(diǎn)和AI虛擬藥物發(fā)現(xiàn)平臺(tái)、英矽智能通過(guò)AI賦能發(fā)現(xiàn)的潛在同類最佳USP1小分子抑制劑、晶泰科技用AI驅(qū)動(dòng)的下一代抗體發(fā)現(xiàn)平臺(tái)XupremAb賦能最佳抗體發(fā)現(xiàn)……這是張江AI新藥研發(fā)聯(lián)盟發(fā)布的一些創(chuàng)新成果。

作為近年來(lái)技術(shù)變革的重要力量,AI在生物醫(yī)藥領(lǐng)域展示了極大的應(yīng)用潛力。國(guó)家發(fā)改委2022年發(fā)布的《“十四五”生物經(jīng)濟(jì)發(fā)展規(guī)劃》提出,要利用云計(jì)算、大數(shù)據(jù)、人工智能等信息技術(shù),對(duì)治療適應(yīng)癥與新靶點(diǎn)驗(yàn)證、臨床前與臨床試驗(yàn)、產(chǎn)品設(shè)計(jì)優(yōu)化與產(chǎn)業(yè)化等新藥研制過(guò)程進(jìn)行全程監(jiān)管,實(shí)現(xiàn)藥物產(chǎn)業(yè)的精準(zhǔn)化研制與規(guī)?;l(fā)展。

2022年2月,英矽智能利用人工智能發(fā)現(xiàn)的“特發(fā)性肺纖維化”候選藥物,獲批在中國(guó)進(jìn)入ⅰ期臨床試驗(yàn),成為中國(guó)首個(gè)進(jìn)入臨床階段的人工智能研發(fā)藥物。

AI打破“雙十定律”

大幅縮短研發(fā)時(shí)間,是AI智藥最明顯的優(yōu)勢(shì)之一。

傳統(tǒng)的新藥研發(fā)是一項(xiàng)復(fù)雜而長(zhǎng)期的系統(tǒng)工程,一款新藥從著手研發(fā)到獲批上市,整個(gè)過(guò)程平均耗時(shí)約14年,僅化合物篩選到臨床前研究就需花費(fèi)約4~6年的時(shí)間,推動(dòng)新藥上市的平均成本更是高達(dá)19.8億美元。

因此,醫(yī)藥研發(fā)行業(yè)長(zhǎng)期以來(lái)面臨著“雙十定律”,即需要耗時(shí)超過(guò)10年、10億美金才有可能上市一款新藥。

張江AI新藥研發(fā)聯(lián)盟成員之一英矽智能聯(lián)合首席執(zhí)行官、首席科學(xué)家任峰表示,為了研發(fā)毒副作用更小的特發(fā)性肺纖維化新藥,英矽智能通過(guò)AI賦能的研發(fā)方式,將從靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)到找到臨床候選化合物的過(guò)程縮短到18個(gè)月,研發(fā)費(fèi)用共投入270萬(wàn)美元,而如果沒(méi)有AI,則該過(guò)程需要花費(fèi)四年半以上時(shí)間、數(shù)千萬(wàn)美元,AI+生物醫(yī)藥的“雙向賦能”,無(wú)疑大大降低了新藥研發(fā)的周期和成本。

同樣也是張江AI新藥研發(fā)聯(lián)盟成員的晶泰科技,在建立小分子藥物模擬算法平臺(tái)之后,通過(guò)AI預(yù)測(cè)算法幫助輝瑞制藥顯著縮短了新冠口服藥Paxlovid(奈瑪特韋片/利托那韋片)的研發(fā)周期,2021年12月,Paxlovid成為第一款獲得美國(guó)FDA批準(zhǔn)的新冠口服藥,被迅速推向市場(chǎng)。輝瑞和晶泰科技雙方的科學(xué)家僅用了6個(gè)星期,便完成了藥物固態(tài)研發(fā),以快速的計(jì)算預(yù)測(cè)與試驗(yàn)結(jié)果相互印證、準(zhǔn)確匹配。而在傳統(tǒng)的藥物研發(fā)模式下,這個(gè)過(guò)程可能需要花費(fèi)數(shù)月時(shí)間。

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晶泰科技AI預(yù)測(cè)模型

目前,晶泰科技已通過(guò)建立算法的“干”實(shí)驗(yàn)室和自動(dòng)化機(jī)器人驅(qū)動(dòng)的“濕”實(shí)驗(yàn)室,構(gòu)建起虛實(shí)結(jié)合、相互印證的研發(fā)體系,助力藥物研發(fā)。自動(dòng)化智能化實(shí)驗(yàn)室里包含了自動(dòng)化合成、自動(dòng)化結(jié)晶等化學(xué)和生物的一些關(guān)鍵能力,通過(guò)人工智能來(lái)輔助藥物設(shè)計(jì),通過(guò)自動(dòng)化機(jī)器人來(lái)替代傳統(tǒng)人工進(jìn)行實(shí)驗(yàn)操作,進(jìn)行7×24小時(shí)的運(yùn)作,實(shí)現(xiàn)“關(guān)燈實(shí)驗(yàn)室”的效果,并減少對(duì)人力勞動(dòng)的依賴,保證實(shí)驗(yàn)的穩(wěn)定可靠。

“例如每一次加反應(yīng)試劑,相比人工,機(jī)械臂可以更加精準(zhǔn)控制劑量,并且實(shí)時(shí)記錄實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)、過(guò)程,全程數(shù)據(jù)可追溯。”晶泰科技相關(guān)人士介紹。

將藥物在人體內(nèi)精準(zhǔn)遞送

受限于傳統(tǒng)藥物研發(fā)的技術(shù)瓶頸,臨床上仍存在大量“不可成藥”的疾病,諸多患者面臨“無(wú)藥可用”的難題。

“藥物遞送”技術(shù)是以RNA藥物為開(kāi)發(fā)的關(guān)鍵環(huán)節(jié),通過(guò)特定的技術(shù)實(shí)現(xiàn)將核酸序列等藥物精準(zhǔn)遞送至有疾病的器官、組織和細(xì)胞中,從而實(shí)現(xiàn)疾病的治愈。然而,這一環(huán)節(jié)的難點(diǎn)和關(guān)鍵在于如何“精準(zhǔn)遞送”藥物有效成分到人體患病部位。

業(yè)內(nèi)人士打比方,人體的運(yùn)作機(jī)制和環(huán)境非常復(fù)雜,實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)的難度不亞于通過(guò)火箭運(yùn)載衛(wèi)星到達(dá)太空中的預(yù)定軌道。也因此,提升藥物遞送的精準(zhǔn)性已成為新一代藥物的核心部分。

如果把藥物比作一輛行駛在人體內(nèi)的車,在人體內(nèi)沒(méi)有GPS的情況下,如何將藥物精準(zhǔn)送達(dá)“目的地”?劑泰醫(yī)藥聯(lián)合創(chuàng)始人兼首席執(zhí)行官賴才達(dá)在論壇上表示,劑泰醫(yī)藥的做法是,基于AI數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)算法、機(jī)制驅(qū)動(dòng)的量子力學(xué)和分子動(dòng)力學(xué)模擬以及高通量實(shí)驗(yàn)平臺(tái)等底層技術(shù),搭建了AI驅(qū)動(dòng)核酸遞送系統(tǒng)設(shè)計(jì)平臺(tái)(AiLNP),以AI驅(qū)動(dòng)干、濕實(shí)驗(yàn)迭代,實(shí)現(xiàn)了更有效的創(chuàng)新遞送材料設(shè)計(jì)、核酸序列設(shè)計(jì)與優(yōu)化,并設(shè)計(jì)了更具優(yōu)勢(shì)的制劑配方和核酸遞送系統(tǒng),將藥物遞送系統(tǒng)效率進(jìn)行指數(shù)級(jí)優(yōu)化。

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劑泰醫(yī)藥AiLNP

“LNP核酸遞送系統(tǒng)的表達(dá)效率超越行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)10倍以上,并破解了行業(yè)難以攻克的肺、大腦、腫瘤、免疫器官、肌肉等遞送難題。”賴才達(dá)說(shuō)。

以近來(lái)火熱的mRNA技術(shù)為例,mRNA技術(shù)商業(yè)落地的最大阻礙便是遞送。在賴才達(dá)看來(lái),遞送技術(shù)可以助力更好地發(fā)揮藥效,將疾病細(xì)胞編寫(xiě)回健康細(xì)胞,為全球患者帶來(lái)革命性的藥物,解決未被滿足的臨床需求,這也是目前CGT(細(xì)胞基因治療)產(chǎn)業(yè)“卡脖子”的核心環(huán)節(jié)。

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