在一項新研究中,科學家開發(fā)了先進的可解釋性人工智能(AI),這是一種破解DNA編碼的調(diào)控指令的技術(shù)路線,在蛋白質(zhì)-DNA相互作用的高分辨率圖譜上訓練的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)可以揭示整個基因組中微妙DNA序列模式,并提供對這些序列組織并調(diào)節(jié)基因方式的更深入理解。
研究于2月18日發(fā)表在《自然-遺傳學》上,標題為“Base-resolution models of transcription-factor binding reveal soft motif syntax”(轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的堿基解析模型揭示了軟基序語法),通訊作者為斯托斯醫(yī)學研究所的Julia Zeitlinger。
新的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)被稱為堿基對網(wǎng)絡(luò)(BPNet),可以解釋為通過預測DNA轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合,來以前所未有的精確度排列揭示調(diào)控代碼地網(wǎng)絡(luò)。這個網(wǎng)絡(luò)的關(guān)鍵是在盡可能高的分辨率下進行轉(zhuǎn)錄因子DNA結(jié)合實驗和計算建模,直至單個DNA堿基的水平。
研究稱,結(jié)果與現(xiàn)有的實驗結(jié)果非常吻合,而且還揭示了令科學家驚訝的新見解。